差额事业编和全额事业编的区别主要包括以下两点：1、财政拨款不同：差额事业编制由财政进行差额拨款;全额事业编制的全额由财政拨款。2、单位性质不同：差额事业编制多数是医院和部分景点;全额事业编多为一些公益性事业单位和部分具有行政执法职能的事业单位。事业单位编制人员适用劳动合同法。

事业编制是事业单位编制的总称，事业编制可分为全额事业编制、差额事业编制和自筹自支事业编制三种，全额编制又叫全额财政拨款事业编制，参照公务员管理，基本待遇与公务员一致，多为一些公益性事业单位和部分具有行政执法职能的事业单位，如城管、学校等。差额事业编制，由财政进行差额拨款，待遇和收入在一定程度上挂钩，如医院和部分景点等。自筹自支事业编制，实际上与企业差不多，待遇和经营状况息息相关，多为一些服务型事业单位，如宾馆、培训中心、设计室等。

一是公益属性不同。全额拨款事业单位公益性质更为明显，本身不参与经营活动，不产生经济收益;差额拨款的事业单位具有一定公益服务项目，但自身通过服务和经营要产生一定的经济收益。

二是单位发挥的职能不同。全额拨款的事业单位属于公益一类的事业单位，比如中小学校、基础科学研究、社会科学研究、文化体育、公共卫生等;差额补款的事业单位属于公益二类的事业单位，比如高等学校、实用性的科研院所、文化演出单位等。

三是经费来源不同。全额拨款事业单位其经费来源全部由财政全额拨款，包括人员的工资、社会保险、办公经费等全部来源财政开支;差额拨款的事业单位，财政是按照差额部分进行拨款，自身会产生一定的收入来源，比如医院，文化体育部门的部分事业单位等。

四是职业年金记账方式不同。全额拨款的事业单位工作人员的职业年金，除了个人缴费部分实行实账管理以外，单位缴费部分实行虚账管理，待工作人员退休时再由财政拨付记实;差额拨款的事业单位，无论是单位缴费部分还是个人缴费部分，都是按照实账进行管理。

五是工作人员的收入不同。全额拨款的事业单位工作人员工资福利待遇，要按照事业单位的工作人员工资管理办法执行，工资要全部纳入财政预算，只能在财政预算的范围内支付;差额事业单位由于有一定的经营收入，除了基本工资以外，大部分收入来源于绩效工资，平均收入水平会高于全额拨款的事业单位。